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CRISPR

 

细菌种类的不同群体的编码阻止特定的活性基因的CRISPR / CAS系统,根据从多伦多大学和奥塔哥大学,新西兰队。扫描原噬菌体(细菌基因组内整合的噬菌体基因组),多伦多的艾伦戴维森和同事已经确定了五个新的蛋白编码抗CRISPR基因,加入九他组先前确定的列表。在该小组的最新作品,发表于六月十三日,自然微生物学杂志上,突出了的方式来学习CRISPR系统是如何工作的,以及为潜在的附加 工具基于CRISPR基因编辑。

 

“这组作者报告红皇后理论,该理论假定,有一种所有生物之间的军备竞赛,特别是宿主和寄生虫之间的一个美丽的应用,说:” 迪迪埃·拉乌尔在艾克斯-马赛大学的微生物学家在法国谁没有参与这项工作。这些蛋白“是噬菌体的回答细菌CRISPR系统这是由细菌侵略的一种形式,”他补充说。

 

“反CRISPR蛋白的发现是在这个意义上并不奇怪,噬菌体必须发展这些作为宿主寄生虫协同进化的自然的一部分,说:” 尤金·库宁的美国国家生物技术信息中心和国家图书馆医学。

 

戴维森的研究小组在2013年发现了在一个单一的噬菌体绿脓杆菌基因组赋予的其他类型的噬菌体的宿主抵抗。因此,研究人员调整了P. 铜绿假单胞菌 CRISPR系统,试图了解噬菌体会如何影响细菌的敏感性噬菌体感染。他们发现P. 铜绿假单胞菌的类型,如果CRISPR系统仅由某些类型的噬菌体感染的预防。噬菌体的基因组内搜索,研究人员发现五绝的基因,每个具有抗CRISPR活动。在随后的研究中,研究人员在确定的另一个表现出活性四个基因对IE类型CRISPR P. 铜绿假单胞菌。

 

对于目前的研究,戴维森的队伍扩大了其搜索到的各种变形菌门中物种的基因组。由于先前确定的蛋白有没有共同的基序,研究人员搜索与同源序列,他们发现相邻的所有已知的抗CRISPR位点的一个假定的转录调节基因。

 

戴维森和同事然后进行测试是否每个推定的抗CRISPR基因,在质粒表达,可以支持噬菌体与任何一种类型的IE内的细菌和IF CRISPR系统针对噬菌体复制的能力。该小组确定了四个多抗CRISPR基因靶向中频系统,再加上一个能够阻止这两种类型IF和IE CRISPR系统的活性。

 

“这里面有很多不同的抗CRISPR基因家族强调,这些基因是有利的噬菌体,而且CRISPR系统提出了一个重要障碍噬菌体复制,”戴维森说的科学家。所有这三个反CRISPR蛋白球队此前测试中的约束体外和一个独特的方式阻止CRISPR功能。

 

据拉乌尔,这些反CRISPR蛋白质可以提供线索,为什么一些细菌和古细菌物种保留外国DNA元素(如原噬菌体等可移动的遗传元素)编码的抗性基因,而有的则没有。“这是一个重要的问题,”拉乌尔说。“我怀疑一个区别可能是这些反CRISPR蛋白质。”

 

抗CRISPR蛋白也可能是有用的实验工具。“这不难想象,这些蛋白质可以用来调节,目前正在使用的Cas9突变体基因组编辑和工程以同样的方式CRISPR系统的活性,或作为一种瞬时调节CRISPR的表情,说:”库宁。

 

多伦多为首的团队正在努力查明对其他CRISPR系统,包括广泛使用的多基因CRISPR / Cas9。

 

“这可能是反CRISPR蛋白质总数的众所周知的只是冰山的一角,”库宁说的科学家。

 

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