circRNAs在灵长类大脑发育和老化过程中表达动态变化和作用

原创作者：生命之美ABLife

环状RNA（Circular RNA，circRNA）是一类比较特殊的RNA，在上个世纪已经发现了它们的存在。但直到2013年以来，随着测序技术的深入应用，circRNA的研究才慢慢兴起 [1, 2]。circRNA往往会在神经相关的组织和细胞中有比较丰富的含量，因此可能会影响相关的一些生物学过程。

circRNAs在哺乳动物大脑中的丰度和功能已被越来越多的广泛关注，但是他们在大脑衰老中的生物学意义还是未知的。

文章题目 ：Annotation and functional clustering of circRNA expression in rhesus macaque brain during aging

中文题目 circRNAs在灵长类大脑发育和老化过程中表达动态变化和作用

期刊名 Cell Discovery IF：4.46

合作单位 中科院昆明动物所

发表时间 2018年9月18日

实验材料 中国猕猴

技术方法 circRNA-seq

为了研究circRNA在哺乳动物，尤其是灵长目动物大脑中的表达特点，以及重要的调控作用，我们在猕猴的脑组织中进行了系统的circRNA表达特点和功能的研究。

借助于二代测序技术，以及生物信息学分析工具，我们在2个年龄段、2种性别的8个不同脑区的组织中进行了circRNA的定量研究。我们共获得了17050个表达比较稳定的circRNA。通过对circRNA进行差异和聚类分析，我们发现有数百个不同的circRNA会呈现出组织特异性，性别表达的特异性，以及年龄的特异性等。而且发现高龄猕猴中，circRNA的表达会呈现出富集的趋势，而且这些circRNAs会跟其host mRNA的表达呈现一些相关性。

Fig1：猕猴中circRNAs的表达模式。

为了验证我们的发现，我们挑选了2个重要的circRNAs进行验证，发现它们确实跟宿主mRNA在表达上呈现负相关的特性，且随着年龄的增长表达量会升高，暗示这些circRNA可能跟衰老存在一些必然的联系。我们的结果揭示了circRNA表达的变化在大脑衰老的生物学过程中潜在的调控作用。

Fig7：CircCACNA2D1和circCACNA1E与宿主mRNA在表达上呈现负相关 。

References:

1. MemczakS, Jens M, Elefsinioti A, Torti F, Krueger J, Rybak A, Maier L, Mackowiak SD,Gregersen LH, Munschauer M, et al: CircularRNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency. Nature 2013, 495:333-338.

2. JeckWR, Sorrentino JA, Wang K, Slevin MK, Burd CE, Liu J, Marzluff WF, SharplessNE: Circular RNAs are abundant,conserved, and associated with ALU repeats. RNA 2013, 19:141-157.